针对古DNA研究中损伤模式分析繁琐且缺乏高效聚类工具的瓶颈,丹麦技术大学与拉瓦尔大学团队开发了AdDeam工具。该工具通过GMM算法实现损伤模式快速聚类,可区分UDG处理样本、不同时期标本的特异性损伤,并能有效识别古微生物组中的现代污染contig。其双模式 ...
本研究针对长读长宏基因组组装准确性评估难题,开发了基于读段剪切事件分析的开源工作流,系统评估了HiCanu、hifiasm-meta、metaFlye和metaMDBG四款工具在21个PacBio HiFi数据集上的表现。研究发现组装错误率高达每1亿碱基对46个错误,揭示多域嵌合体、过早环化等 ...
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