本研究针对宏基因组学分析中软件工具对结果的影响问题，系统评估了MG-RAST、MEGAN6和Kraken2在藏红花球茎圈（cormosphere）鸟枪法宏基因组数据分析中的表现。研究发现Kraken2在物种分类分析中显著优于其他工具，能获得更高的α多样性值，但缺乏功能分析模块。