微生物与癌症的关联性长期存在争议。来自多机构的研究团队通过重新分析癌症基因组图谱(TCGA)的5734个全基因组测序(WGS)数据，采用升级的计算方法和数据库，系统评估了细菌、病毒和真菌在25种癌症中的真实存在情况。研究证实既往报道中存在大量由技术误差 ...

我们开发了一种新颖的深度学习网络，该网络基于迁移学习和微调，整合了无进展间隔（PFI）作为条件，并利用途径-基因（KEGG）关系来预测癌症基因组图谱（TCGA）RNA-seq表达数据的总生存期（OS）。在实际应用中，获取临床和实验数据可能成本高昂，这通常导致 ...

尽管微生物群组研究不断扩展，但由于难以获得临床活检组织，研究内部器官的微生物组成及其与疾病的关系仍然具有挑战性。 《癌症基因组图集》（TCGA）中的测序数据包含人类各器官肿瘤和微生物基因组的测序片段信息。最近，对TCGA测序数据的分析已被用来 ...

TCGA，英文全称是The Cancer Genome Atlas，是美国国家癌症研究所NCI和美国人类基因组研究所NHGRI共同开发的大型肿瘤研究项目，利用高通量和多组学的肿瘤基因组分析技术，加深人类对肿瘤的认知，提高肿瘤的预防、诊断和治疗。 TCGA数据库收录了33种癌症，超过20000 ...

如何根据TCGA的Maf文件和Matedata信息，查找含有特定突变的样本的编号，进而从TCGA分别下载TN配对的测序数据？第一部分内容见： ...

多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型，为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。 基因病变是癌症的根本原因，也是基因调控变化的驱动力，而基因调控变化是癌症的经典表型 ...

伴随着中国老龄化的加速，“带瘤生存”和新发癌症比例正逐渐上升。癌症早筛早检在国内进入了黄金时期。 10月11日，基准医疗(AnchorDx)与美国著名基因公司Twist Bioscience（拓维思特，纳斯达克股票代码：TWST）公布了联合开发的用于泛癌种研究的甲基化文库制备 ...

中美科技战终于打到了生物领域，我国的生物科研道路可谓路漫漫其修远兮。 中美科技战终于打到了生物领域。 2月28日，美国白宫发布消息称，拜登正式签署了《关于防止关注国家获取美国公民大量敏感个人数据和美国政府相关数据的行政命令》（Executive Order ...